Legenda e contornos em gráficos de nível

Peso de 100 grãos em função do nível de saturação de água e potássio. Contornos e rótulo na escala de cores são os destaques desse gráfico.

Mais uma ridícula de lattice. Fiz duas coisas: adicionei rótulo à legenda de cores (colorkey) e coloquei contornos sobre o gráfico de níveis. Assim como a maioria das dicas gráficas, essa também é baseada nas mensagens da r-help. Os respectivos links estão no CMR. Até a próxima ridícula.

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# leitura dos dados

soja <- read.table("http://www.leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/cnpaf/soja.txt",
                   header=TRUE, sep="\t", dec=",")
str(soja)

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# ver o peso de 100 grãos

require(lattice)

xyplot(pesograo~potassio, groups=agua, data=soja, type=c("p","a"))
xyplot(pesograo~potassio|agua, data=soja, type=c("p","a"))

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# ajuste de um modelo polinomial nos dois fatores

m0 <- lm(pesograo~bloco+poly(agua,2)*poly(potassio,2), data=soja)
par(mfrow=c(2,2)); plot(m0); layout(1)

summary(influence.measures(m0))
soja[55,] # influente segundo dffits

m0 <- lm(pesograo~bloco+poly(agua,2)*poly(potassio,2),
         data=soja[-55,])
par(mfrow=c(2,2)); plot(m0); layout(1)

anova(m0)
summary(m0)

m1 <- lm(pesograo~bloco+(agua+I(agua^2))*potassio+I(potassio^2),
         data=soja[-55,])
par(mfrow=c(2,2)); plot(m1); layout(1)

anova(m0, m1)
summary(m1)

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# fazendo a predição

pred <- expand.grid(bloco="I", agua=seq(37.5,62.5,l=30),
                    potassio=seq(0,180,l=30))
pred$y <- predict(m1, newdata=pred)

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# representando com wireframe()

require(RColorBrewer)

display.brewer.all()
colr <- brewer.pal(11, "RdYlGn")
colr <- colorRampPalette(colr, space="rgb")

zlab <- "Peso de 100 grãos"
xlab <- "Potássio no solo"
ylab <- "Nível de saturação de água"

wireframe(y~potassio*agua, data=pred,
          scales=list(arrows=FALSE), zlab=list(zlab, rot=90),
          xlab=list(xlab, rot=24), ylab=list(ylab, rot=-37),
          col.regions=colr(100),  drape=TRUE,
          screen=list(z=40, x=-70))

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# representando em um levelplot()

# grid mais fino
pred <- expand.grid(bloco="I", agua=seq(37.5,62.5,l=100),
                    potassio=seq(0,180,l=100))
pred$y <- predict(m1, newdata=pred)

levelplot(y~potassio*agua, data=pred, col.regions=colr(100),
          xlab=xlab, ylab=ylab)

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# adicionando rotulo à legenda de cores, baseado nas mensagens da r-help
# http://r.789695.n4.nabble.com/Adding-title-to-colorkey-td4633584.html

library(grid)

# modo 1
levelplot(y~potassio*agua, data=pred, col.regions=colr(100),
          xlab=xlab, ylab=ylab,
          par.settings=list(layout.widths=list(axis.key.padding=4)))
grid.text(zlab, x=unit(0.88, "npc"), y=unit(0.5, "npc"), rot=90)

# modo 2
levelplot(y~potassio*agua, data=pred, col.regions=colr(100),
          xlab=xlab, ylab=ylab,
          ylab.right=zlab,
          par.settings=list(
            layout.widths=list(axis.key.padding=0, ylab.right=2)))

require(latticeExtra)

# modo 3
p <- levelplot(y~potassio*agua, data=pred, col.regions=colr(100),
               xlab=xlab, ylab=ylab,
               par.settings=list(
                 layout.widths=list(right.padding=4)))
p$legend$right <- list(fun=mergedTrellisLegendGrob(p$legend$right,
                         list(fun=textGrob, args=list(zlab, rot=-90, x=2)),
                         vertical=FALSE))
print(p)

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# adicionando contornos, baseado em
# https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2006-February/088166.html

#png(file="f037.png", width=500, height=400)
p <- levelplot(y~potassio*agua, data=pred, col.regions=colr(100),
               xlab=xlab, ylab=ylab,
               panel=function(..., at, contour=FALSE, labels=NULL){
                 panel.levelplot(..., at=at, contour=contour, labels=labels)
                 panel.contourplot(..., at=at, contour=TRUE,
                                   labels=list(labels=format(at, digits=4),
                                     cex=0.9))
               },
               par.settings=list(
                 layout.widths=list(right.padding=4)))
p$legend$right <- list(fun=mergedTrellisLegendGrob(p$legend$right,
                         list(fun=textGrob, args=list(zlab, rot=-90, x=2)),
                         vertical=FALSE))
print(p)
#dev.off()

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Tags: gráficos, lattice, levelplot