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Pour libérer la mémoire, il faut supprimer tous les objets non utilisés avec rm. Si on veut tout supprimer, on peut faire un :
rm(list=ls())
Ou, pour inclure aussi les objets commençant par un . :
rm(list=ls(all.names=TRUE))
Mais ceci ne suffit pas, il faut ensuite lancer un garbage collection pour réellement libérer la mémoire utilisée par ces objets. Pour cela, la commande gc() devrait suffire :
gc()